Se ha finalizado un ensayo clínico fase I que valoraba los efectos de la administración intratecal e intravenosa de péptidos sintéticos de la proteína básica de la mielina sobre los niveles libres y ligados de la proteína básica de la mielina en el LCR. No se reportaron efectos adversos. Recientemente, se han iniciado estudios que investigan la seguridad y eficacia de análogos peptídicos de la proteína básica de la mielina (ligandos peptídicos modificados). Estos péptidos se unen a receptores relevantes de células T sin llegar a convertirlas en células T activadas de una forma que más bien induce la producción de citocinas antiinflamatorias que proinflamatorias. Teóricamente, esta forma de terapia peptídica puede conducir a un tratamiento que inactive específicamente aquellas células T implicadas en la EM.